Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MKLN1Q9UL63 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms