Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ITGA11Q9UKX5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms