Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIV1

CNOT7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT7Q9UIV1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNOT7Q9UIV1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CNOT7Q9UIV1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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