Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms