Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SFMBT1Q9UHJ3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms