Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CHRNA9Q9UGM1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CHRNA9Q9UGM1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms