Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPASTQ9UBP0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPASTQ9UBP0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms