Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC88CQ9P219 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms