Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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RDH8Q9NYR8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH8Q9NYR8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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