Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABCF3Q9NUQ8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms