Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PKDREJQ9NTG1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PKDREJQ9NTG1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms