Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
EMILIN3Q9NT22 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms