Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RRP7BPQ9NSQ0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms