Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SNTG1Q9NSN8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNTG1Q9NSN8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms