Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TM7SF3Q9NS93 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TM7SF3Q9NS93 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms