Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY4

ARHGAP35, Rho GTPase-activating protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP35Q9NRY4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARHGAP35Q9NRY4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGAP35Q9NRY4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms