Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SDHAF3Q9NRP4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms