Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FZD3Q9NPG1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FZD3Q9NPG1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms