Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NRDE2Q9H7Z3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NRDE2Q9H7Z3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms