Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BHLHE41Q9C0J9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
BHLHE41Q9C0J9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms