Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVK-6Q9BXR3 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms