Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HIRIP3Q9BW71 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HIRIP3Q9BW71 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms