Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC32Q9BV29 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms