Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf16Q9BUW7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf16Q9BUW7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms