Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TREX2Q9BQ50 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TREX2Q9BQ50 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms