Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RETNLBQ9BQ08 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms