Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MYD88Q99836 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYD88Q99836 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms