Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAM1Q96QH2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAM1Q96QH2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAM1Q96QH2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAM1Q96QH2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAM1Q96QH2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAM1Q96QH2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms