Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC43Q96MW1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms