Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
FGD4Q96M96 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FGD4Q96M96 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms