Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
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C2orf48Q96LS8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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C2orf48Q96LS8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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C2orf48Q96LS8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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C2orf48Q96LS8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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C2orf48Q96LS8 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C2orf48Q96LS8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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