Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SHDQ96IW2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms