Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD2Q96BF3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms