Protein–RNA interactions for Protein: Q96BD6

SPSB1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB1Q96BD6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPSB1Q96BD6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms