Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF428Q96B54 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms