Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RFT1Q96AA3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RFT1Q96AA3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms