Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
USP13Q92995 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
USP13Q92995 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
USP13Q92995 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
USP13Q92995 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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