Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMIEQ8NEW7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms