Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TTC29Q8NA56 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms