Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
LINC00612Q8N6U2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms