Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IFNL1Q8IU54 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms