Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CD163Q86VB7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms