Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUP54Q7Z3B4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms