Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOM1L2Q6ZVM7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOM1L2Q6ZVM7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms