Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BEND4Q6ZU67 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BEND4Q6ZU67 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms