Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LIAT1Q6ZQX7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LIAT1Q6ZQX7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms