Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPOCD1Q6ZMY3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SPOCD1Q6ZMY3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms