Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM72Q6ZMU5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TRIM72Q6ZMU5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms