Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC00575Q6W349 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms