Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCBE1Q6UXH8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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